все прошики которые меняются кастомно (в частности - чип тюнинг) делаются с сохранением идентификаторов. Если это простое обновление вышедшего ПО , например появилась новая прошивка на коробку передач. то тут вообще всем пофиг будет. Если при смены конфигурации бы заливалось новое ПО то точно никто не жаловался что чтото не работает. Из этого вывод можно попробовать активировать будет рбаотать хорошо - нет так нет вернете все обратно.
Гарантийщики любят припугнуть )))